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Sanger测序套峰拆峰教程(工具法&手动拆峰)

进哥哥Jingle  · 公众号  ·  · 2024-01-29 13:06
    

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其实我网站有转载的一篇文章有介绍( 怎么拆分Sanger 测序图谱套峰? – 王进的个人网站 )这边重新简化了一下,进一步方便大家理解使用。 1. Shiny app 拆峰 该App是进哥根据 PolyPeakParser: Run Poly Peak Parser in sangerseqR: Tools for Sanger Sequencing Data in R: https://github.com/jonathonthill/sangerseqR 修改简化,然后部署在shinyapp.io上面方便有需要的同学使用: 结果如下: App 入口请查看原文 操作很简单,不想多介绍,不明白的话的话直接看 B 站视频吧。。。 B站视频: https://www.bilibili.com/video/BV1SZ4y1E73p/?vd_source=74c93391f1766f275cbe9cbe69ede611 2. 手动拆峰教程: 首先, snapgene 打开测序文件: 定位到套峰开始位置,将前后一段序列的每个碱基位点的两个碱基写下来,形成两条碱基序列(如下图)。实际上可以想象,在单一突变后应该存在两种序列,其中一条应该与参考序列一样 ………………………………

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