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Nature Methods | scEpiChem-单细胞水平检测药物/化学小分子-染色质互作新技术

科研这点事儿  · 公众号  ·  · 2024-07-23 04:00

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小分子在调节细胞过程、影响基因表达、染色质结构和信号通路方面发挥着作用。这些相互作用是各种治疗干预措施的基础,包括传统药物和先进的靶向疗法。 尽管许多小化学分子药物的疗效已通过与基因组的相互作用在医学治疗中得到充分证实,但基因组相互作用背后的具体机制通常仍不清楚。绘制与DNA或染色质相关蛋白结合的小分子图谱对于阐明它们在抗癌治疗中的作用至关重要。 到目前为止, 只有少数技术被报道用于测量大样本中小分子与细胞DNA之间的相互作用,而这些技术通常需要数百万个细胞 。例如,Chem-seq和Click-Chem-seq利用亲和标签来富集治疗药物结合的剪切染色质,从而检测小分子的基因组结合。Chem-map能够通过靶标标记来映射这些相互作用,这种生化设计广泛用于分析染色质蛋白-DNA相互作用;然而, 迄今为止,小分子-靶标参与 ………………………………

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