Nat. Chem. Biol. | 虚拟筛选库扩展的建模

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DRUG AI 今天为大家介绍的是来自Brian K.Shoichet团队的一篇论文。最近，“实物”（tangible）虚拟库已经使数十亿种分子变得触手可及。对这些分子进行优先合成和测试需要计算方法，例如分子对接。它们的成功可能取决于库的多样性、与生物类似分子的相似性以及随着库的扩展，受体适应性和伪影的变化。作者将一个包含300万种“库存”（in-stock）分子的库与数十亿种实物库进行了比较。与“库存”分子相比，实物库中对生物类似分子的偏向性减少了1.9万倍。同样，在五次超大库的分子对接活动中，数千种排名靠前的分子，包括实验中表现活跃的分子，也与生物类似分子不同。同时，随着库的扩展，发现了更适合的分子，评分随着库的增长呈对数线性改善。最后，随着库规模的增加，排名异常靠前的稀有分子也增多。虽然这些伪影的性质因目标不同而 ………………………………