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Nat. Chem. Biol. | 通过同源蛋白跳跃与共价探针发现CCNE-CDK2 别构调节位点

王初课题组  · 公众号  ·  · 2024-09-28 21:58
    

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大家好,今天分享一篇发表在 Nat. Chem. Biol. 上的文章“An allosteric cyclin E-CDK2 site mapped by paralog hopping with covalent probes”,本文的通讯作者是来自 Scripps 研究所的 Benjamin Cravatt 教授。 这篇文章中作者分析了具有高活性半胱氨酸蛋白的同源物的配体可及性。 人类基因编码蛋白共有约 20000 个,其中有超过一半有同源蛋白,它们在细胞中执行重叠但不同的功能,具有序列和结构相关性。化学蛋白质组学帮助我们发现了亲电敏感的半胱氨酸组,为这些蛋白的配体发现奠定了基础。那么,这些结果是否能为不含有半胱氨酸的同源蛋白的配体发现提供帮助呢? 本文研究了细胞周期蛋白 CCNE ,其中 CCNE2 的 Cys109 已通过化学蛋白质组学方法证明是可被( R , R ) - 色普托啉丙烯酰胺( WX-03-59 )及其炔基化探针( WX-03-348 )共价配位的。为了研究同源蛋白 CCNE1 是否有 ………………………………

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