空间通讯分析：揭示细胞对互作网络的新视角

文章预览

上期我们介绍了 《细胞通讯CellChat工作原理及应用思路》 ，本期我们继续介绍空间转录组通讯分析原理及应用思路。 本期内容主要有空间通讯分析原理（2个软件）、结果展示及应用思路。 一、空间通讯分析原理 1 CellChat原理及步骤 1.1 生物学背景及原理 物理接近性： 通过识别物理上接近的细胞对，来推断它们之间的生物学交互作用。这是基于最大可能的分子相互作用/扩散范围来确定的。 扩散距离： 分子在空间组织中的扩散距离取决于多种因素，例如分子大小、共价修饰、空间组织的密度以及细胞膜和细胞外环境中的调节因子。这些因素通常会减少分子的扩散距离。 理想扩散范围： 在CellChat软件中，使用在自由介质中的理想扩散范围（默认250 μm）来确保不会排除任何空间上可能的相互作用。 接触依赖性信号： 对于接触依赖性的信号传递（数 ………………………………