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iSeq是什么？ iSeq是由浙江大学陈铭团队开发，发布于Bioinformatics期刊的一款工具。用一句话概括，iSeq 是一个 Bash 脚本，允许您从 GSA、SRA、ENA 和 DDBJ 数据库下载测序数据和样本信息数据。 资源地址： github.com/BioOmics/iSeq?tab=readme-ov-file 工具发布期刊： Haoyu Chao, Zhuojin Li, Dijun Chen, Ming Chen, iSeq: An integrated tool to fetch public sequencing data, Bioinformatics, 2024;, btae641, https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btae641 [PMID: 39447029 ] 下载： iSeq下载非常便捷，只需一行代码 conda install bioconda::iseq 实操： ①下载原始数据： 首先输入想下载数据集的accession number。如下所示 iseq -i GSE122139（accession number） 目前iseq支持下载的物种数据库包含的accession前缀如下： Databases BioProject Study BioSample Sample Experiment Run GSA PRJC CRA SAMC \ CRX CRR SRA PRJNA SRP SAMN SRS SRX SRR ENA PRJEB ERP SAME ERS ERX ERR DDBJ PRJDB DRP
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