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GEO数据库没有自己想要的生信数据,该怎样发文章、设计课题?

生信狂人团队  · 公众号  ·  · 2024-10-14 13:47
    

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现在已经开学了,很多研究生是需要准备开题了或者有些临床需要准备申请课题拿经费,可能你的导师或者科室主任会下达这样的任务: 赶紧去找一个基因来做功能实验,过几个月就开题了(研究生)或者申请课题了(临床医生)。 一般这种老板都是直接给一句话你, 并不会教你怎么样找到一个适合做功能实验的基因,都是要靠自己自力更生。 按照之前的经验基本都是这样找的: 直接测序(有钱人的做法) 生信数据挖掘(穷人的做法,现在out了) 对于很多人来说,前期没有什么经费,都是依靠生信数据挖掘来筛选基因的, 前几年是非常流行的,不过现在的话早就out了,主要因为以下的局限性: 数据资源非常局限(GEO、TCGA) 对非肿瘤不够友好(只能挖掘GEO甚至找不到数据) 样本量比较小(很多非肿瘤数据样本不超过20) 容易课题撞车(被挖 ………………………………

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