富集分析常见类型

文章预览

关注公众号，发送 R语言 或 python ，可获取资料 💡专注R语言在🩺生物医学中的使用 设为“ 星标 ”，精彩不错过 医学和生信笔记公众号主要分享4大块内容： 生信数据挖掘 医学统计分析 机器学习 临床预测模型 前期主要是以 医学统计 和 临床预测模型 为主，关于 生信挖掘 和 机器学习 的内容偏少，所以后面会逐渐增加这方面的内容，除了 常见的生信分析 外，还会涉及一些 SCI图表学习 等内容。 富集分析作为了解基因功能的常用方法，也是各种生信相关SCI中的常客，基本上是必会的内容。 今天为大家带来常见的富集分析类型，其实主要就是两类： ORA(Over-Representation Analysis) ，通过超几何分布检验实现 基因集富集分析GSEA(gene set enrichment analysis) 除此之外，还有 ssGSEA 、 GSVA 等，我们等下次再介绍。 富集分析的可视化 ，我们也是放到下次再介绍， ………………………………