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手把手教学:原始数据如何上传到NCBI

生信人  · 公众号  · 生物  · 2024-12-23 07:00
    

主要观点总结

该文章提供了将测序数据上传到NCBI的详细步骤,包括注册NCBI账号、准备上传的原始数据、填写并提交相关信息、使用Aspera上传文件等。

关键观点总结

关键观点1: 上传测序数据到NCBI的步骤

文章详细描述了从注册NCBI账号开始,准备原始数据,填写并提交各种信息,包括SRA文件汇总信息,使用Aspera或其他方式上传文件等步骤。

关键观点2: 测序数据上传的注意事项

文章指出在上传过程中需要注意的一些事项,如所有文件应放在同一个目录下,避免多层目录,填写信息时的必填和选填项目等。

关键观点3: 使用Aspera进行文件上传的方法

文章介绍了Aspera的安装和设置,以及如何下载key file并使用Aspera命令进行文件上传。

关键观点4: 直播活动和最新文章汇总的介绍

文章最后提到了生信人的直播活动和最新文章汇总,包括神经免疫、肺癌研究、基因组学课程等话题。


文章预览

现在很多文章发表要求一定要上传原始测序数据,今天手把手教学下如何将自己的测序数据上传到NCBI。 注册NCBI账号 注册网站 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/account/ 准备上传的原始数据 原始数据以gz或者其它形式压缩,所有数据放到同一个目录下,不要套多层目录 填写数据信息并上传文件 创建新的submission 进入NCBI首页( https://www.ncbi.nlm.nih.gov/ ),操作如下: ①选择SRA ②点击Search ③点击Submit to SRA ④点击New submission 填写提交者信息(Submitter) 按照要求填写,*为必填选项。填写完成后点击Continue。 填写一般信息(General Information) 如果是第一次提交BioProject和BioSample都选择No,Release data(释放数据的时间)建议选择比较晚的日期,避免数据过早发布,选择早了也没关系提交以后可以修改。填写完成后点击Continue。 填写项目信息(Project Info) 需要填写项目标 ………………………………

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