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Science发表首个人类剪接体图谱,揭示RNA剪接交叉调控的复杂网络

测序中国  · 公众号  · 科学  · 2024-11-18 16:52

主要观点总结

西班牙基因组调控中心的研究团队绘制了人类剪接体的第一张图谱,通过系统性敲低305个剪接相关蛋白质编码基因来研究剪接因子对转录组和剪接位点选择的影响。这项研究揭示了剪接因子的交叉调节网络、不同类别AS事件之间的功能关系以及U1 snRNP蛋白在剪接位点选择中的不同功能。研究指出,纠正剪接错误的药物可能改变治疗策略,并将这些疗法纳入主流。该开创性研究揭示了剪接体的高度互联性,为设计新的治疗方法提供了信息。

关键观点总结

关键观点1: 研究人员成功绘制了人类剪接体的第一张图谱。

为了深入了解剪接机制,研究人员系统性地敲低了Hela细胞系中的305个剪接相关蛋白质编码基因。

关键观点2: 揭示了剪接因子的交叉调节网络。

研究发现在AS的调节过程中,编码SF和RNA结合蛋白的基因在SFs敲低后AS水平上受影响最大。

关键观点3: 揭示了不同类别AS事件之间的功能关系。

研究人员关注了U1 snRNP复合物的功能连接作用,并发现U1A在Alt5’ss选择中发挥作用,但并非外显子包含或跳跃的决定因素。

关键观点4: 该研究的发现为设计新的治疗方法提供了信息。

文章指出,扰乱剪接体中的一个组件可以在整个网络中产生广泛的连锁反应,这为癌症和其他疾病的治疗提供了新的思路。


文章预览

人体中的各项生命活动都依赖DNA的指导,这些指令通过转录成RNA,再由RNA翻译成蛋白质而实现,这便是大名鼎鼎的“中心法则“。然而人类大约有20000个蛋白质编码基因,却能产生至少5倍的蛋白质,这是为什么呢?这就是RNA转录后剪接的神奇之处。 RNA剪接是去除RNA的非编码片段,将剩余的编码序列拼凑在一起,从而形成不同蛋白质的模板。这是RNA转录后修饰的关键过程,一旦发生剪接错误,就可能导致癌症、神经退行性疾病和遗传疾病。由于RNA可变剪接(AS)的复杂性,剖析其剪接位点选择机制目前仍是一项巨大挑战。 西班牙基因组调控中心(CRG)的研究人员耗时10余年成功绘制了人类剪接体的第一张图谱。 研究团队敲低了人类癌细胞中的305个剪接体和不同类别AS决定的功能性剪接因子,进行全转录组分析,并重建了不同功能性剪接因子网络, 发 ………………………………

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