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糖类是自然界中最丰富的有机物质,对生命至关重要。近年来,对糖类药物的研究显著增加,糖生物工程技术也被列入《国家中长期科学和技术发展规划纲要》确定的重点领域及前沿技术。了解糖类如何在生理和病理过程中调节蛋白质,将有助于解决关键的生物学问题和开发新药。了解该调节过程的第一步是发现糖类的结合位点,但是,受限于糖类的多样性和复杂结构,实验识别蛋白质上的糖类结合位点成本高且效率低,计算方法又面临训练数据有限,模型能力不强的问题,这阻碍了蛋白质糖结合位点的精准识别,也从研究的早期开始就影响了对糖类分子机制的理解和糖类药物的开发。 近日,中国科学院上海药物研究所糖测序联合交叉攻关团队开发了一种基于深度学习的新算法 —— DeepGlycanSite ,用于准确预测蛋白质结构上的糖类结合位点。该方
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