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大家好,本周为大家分享一篇发表在Cell Research上的文章Accurate de novo design of heterochiral protein–protein interactions,通讯作者是来自西湖大学的卢培龙研究员和清华大学的刘磊教授,他们的主要研究方向分别是蛋白质设计和蛋白质化学合成。 D-蛋白是由D-氨基酸和非手性氨基酸如甘氨酸组成的蛋白,其可以与天然的L-蛋白靶标形成特定的异手性蛋白-蛋白质相互作用(PPIs),具有高度的生物正交性和稳定性。为了识别结合L-蛋白靶标的D-蛋白分子,已经开发了镜像噬菌体展示技术,然而展示技术无法靶向靶标蛋白的特定表位,且无法确认初始随机库中是否存在足够有效的结合剂。 与传统的筛选方法相比,计算设计提供了一种靶向特定表位的策略,已经报导了若干设计L-蛋白以结合天然蛋白的例子。然而,PDB中只包含很少的D-蛋白与L-蛋白之间异手性相互作用的
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