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Basic Information 英文标题:Integrative mapping of human CD8+ T cells in inflammation and cancer 中文标题:整合性地绘制人类炎症和癌症中的CD8+ T细胞图谱 发表日期:29 November 2024 文章类型:Resource 所属期刊:Nature Methods 文章作者:Ziwei Xue | Linrong Lu 文章链接:https://www.nature.com/articles/s41592-024-02530-0 Abstract Para_01 CD8+ T细胞在炎症和癌症中表现出显著的表型多样性。然而,对其克隆景观和动态的全面理解仍然难以捉摸。 在这里,我们介绍了scAtlasVAE,这是一种基于深度学习的模型,用于整合大规模单细胞RNA测序数据和跨图谱比较。 scAtlasVAE使我们能够构建一个广泛的人类CD8+ T细胞图谱,包括来自68项研究和42种疾病条件下的961个样本中的1,151,678个细胞,并附有配对的T细胞受体信息。 通过整合T细胞受体克隆扩增和共享的信息,我们成功地建立了不同细胞亚型之间的联系,
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