Heliyon | 单细胞测序鉴定高级别浆液性卵巢癌中雌激素反应相关的STRA6+颗粒细胞

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇文章“ Identification of estrogen response-associated STRA6+ granulosa cells within high-grade serous ovarian carcinoma by single-cell sequencing ”，这篇文章发表在Heliyon期刊上，影响因子为3.4。 结果： HGSOC中的单元映射 两个HGSOC单细胞数据集，GSE 192898（ovCHA 004、ovCHA 017、ovCHA 018、ovCHA 034、ovCHA 039、ovCHA 066、ovCHA 070、ovCHA 107、ovCHA 110）、GSE 211956（Y2、Y3、Y 5、MJ 10、MJ 11）。作者首先去除了批次效应，并在双数据集中进行了数据质量控制，保留了来自34，981个细胞的数据（图1A-D）。在用Seurat软件包进行单细胞数据分析后，鉴定了11个主要细胞亚群，内皮细胞、巨噬细胞、NK/T细胞、B细胞、卵巢基质细胞1、卵巢基质细胞2、卵巢基质细胞3、血浆B细胞、肌成纤维细胞、上皮细胞1、上皮细胞2（图1A）。在11个细胞亚群中特异性表达的标志物基因显示在图1B-C ………………………………