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GCAS:基于GEO数据库整理的多种癌症的综合分析工具(R包/app)

进哥哥Jingle  · 公众号  ·  · 2025-03-06 09:00
    

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写在前面 :进哥本科生物技术专业,硕士博士都是卫生毒理学,目前博后仍然是卫生毒理学,生信完全由于兴趣,为什么要搞这些数据库和分析工具呢? 两个方面,其中最主要的可能是在基础研究上感觉到了迷茫和无力,不知道做了一篇完整的paper到底有什么实际意义,找不到成就感,想做一些更有意义和成就感的事;另一个就是我平时研究,包括本身的肺癌方向研究以及合作者其他肿瘤类型的研究,很多分析都是套路分析,就想着做一个分析组件,为大家节省时间,希望能帮助到大家。 目前已经完成的有三个数据库/R包/App: 1. 转录因子-靶基因预测工具TF Target Finder: https://mp.weixin.qq.com/s/gWvwI5Tx8e4IDZjpT8Fusg  ; 2. 基于CPTAC数据库的癌症多组学(蛋白组/转录组/磷酸化蛋白组)分析套件PCAS: https://mp.weixin.qq.com/s/sa17MzmAOuulK1IS8foYoQ  ; 3. 本文介绍的工 ………………………………

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