公共数据的信息不可全信

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我在前面的笔记： 微生物真难搞啊，单个物种居然有几千个参考基因组 提到了一个新鲜出炉的多组学文章（包括微生物的代谢组，转录组，单细胞转录组），题目是《Hosts Manipulate Lifestyle Switch and Pathogenicity Heterogeneity of Opportunistic Pathogens in the Single-cell Resolution》。其中转录组部分的数据链接在：https://ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE232120 GSM7315552_Control1.txt.gz 20.0 Kb GSM7315553_Control2.txt.gz 19.9 Kb GSM7315554_Control3.txt.gz 20.1 Kb GSM7315555_Control4.txt.gz 20.1 Kb GSM7315556_Larvae1.txt.gz 19.9 Kb GSM7315557_Larvae2.txt.gz 16.9 Kb GSM7315558_Larvae3.txt.gz 19.2 Kb GSM7315559_Larvae4.txt.gz 20.4 Kb GSM7315560_Larvae5.txt.gz 20.0 Kb 很容易批量读取它们，详见我在前面的笔记： 微生物真难搞啊，单个物种居然有几千个参考基因组 ，有意思的是文章给出来了的两分组的差异分析非常完美，如下所示 ………………………………