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DIISCO:一种分析肿瘤时间动态细胞间相互作用的革命性方法

生信益站  · 公众号  ·  · 2024-10-14 08:00

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DIISCO 是一种机器学习方法。它的输入是随时间变化的细胞类型比例和已知受体-配体对的基因表达。它的输出是随时间变化的细胞类型动态以及表征细胞间相互作用强度及其随时间变化的网络。 细胞间相互作用在我们的身体对治疗的反应中起着至关重要的作用。在癌症的背景下,免疫细胞彼此之间以及与癌细胞之间相互作用,决定了患者的疾病是缓解还是复发。追踪这些相互作用在治疗过程中如何演变是了解为什么有些患者反应良好而其他患者反应不佳的关键。然而,目前的工具并没有考虑到这些随时间的变化,限制了它们捕捉这些细胞相互作用全貌的能力。 # 联系站长——扫码最后一张图的二维码来QQ群交流。 为了解决这一差距,Azizi 实验室开发了 DIISCO,这是一种新方法,它使用单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 数据分析细胞相互作用随时间的变化。传 ………………………………

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