Nature | 转录因子如何寻找细胞类型特异的增强子？

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转录因子协调基因表达、塑造细胞命运，然而转录因子 如何高效寻找并结合细胞类型特异的增强子 （enhancer） 是尚未明确回答的问题[1], [2]。 最新一项发表在Nature的工作提出“ 指导寻找模型 （guided-search model） ”，认为转录因子并不是随机“碰到”高亲和的motif，而是 以组合的方式识别呈递在核小体串3D结构上的motifs ，并在这些 核小体串的“指导”下定向移动到附近的增强子 [2]。 Guided-search模型; 及其展示的两种 “指导” 策略，1. 沿着loop定向移动到附近的增强子；2. 在loops交接的地方聚集并移动到附近的增强子[2]。 该项工作主要基于多种 转录因子组合驱动的细胞重编程模型 ，结合转录因子在基因组的结合位置 （ChIP-seq） [3]、核小体占位 （MNase–seq） [4]、染色质开放性 （ATAC-seq） [5]以及核小体分辨级别的3D基因组 （Micro-C） [6]来 整合分析细 ………………………………