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分子构象的变化总是会影响分子的性质,从而导致期望的分子功能与实际分子功能之间的偏差。这一效应在有机分子荧光中往往有着非常明显的表现,通常表现为由分子内或分子间作用力所带来的荧光猝灭和最大发射峰的偏移。通过研究者会对有机分子进行共价修饰引入刚性的不饱和键、分子内氢键、分子间排斥作用等方式在单分子层面限制分子运动,从而抑制其相关的构象变化,形成类似“锁”的结构从而达到理想的荧光性能。然而,额外引入的不饱和键,例如双键或苯环往往会带来原有共轭结构的改变,导致其不能保留原有有机分子的荧光性能;而氢键等非共价相互作用往往对环境较为敏感,随着浓度或温度的改变,这些非共价相互作用往往也会产生巨大变化。这些因素最终都影响着其荧光性质和稳定性。这些原因都导致了很多有机荧光分子
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