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攻克难成药靶点,AI赋能虚拟筛选带来成功案例

医药魔方  · 公众号  ·  · 2024-11-12 07:48
    

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GPX4是细胞铁死亡过程中的重要靶点,GPX4负责催化还原的过氧化脂质都是嵌入在细胞膜中的,为了贴合平坦的细胞膜表面, GPX4的催化口袋非常平坦,类似于蛋白蛋白界面 ,不是常规意义上的可药口袋,这对非共价靶向GPX4的催化口袋造成了很大的难度。 图1 GPX4的催化位点很浅,类似于蛋白蛋白界面 特殊的虚拟筛选流程 ▌ 第一步 需要一个特大化合物库 在靶向这类平坦的口袋时,在特大化合物库中进行筛选是非常有必要的,因为 平坦的口袋能提供的作用力有限,只有极少数小分子能完美地贴合到口袋上,并充分利用这些作用力来达到较高的活性。 特大化合物库中的分子一般由化学砌块通过不同类型的单步化学反应组合而成,其分子数量能达到10亿以上,这为找到那些极少数能靶向GPX4催化口袋的分子提供了足够大的基数。 目前还没有任何湿实验方 ………………………………

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