专栏名称: 三代测序探索者
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Plant Com 综述| Direct RNA 测序在植物中的实际应用和未来展望

三代测序探索者  · 公众号  ·  · 2024-10-09 20:22
    

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点击蓝字 关注我们 近年来,二代短读长RNA测序(RNA-seq)技术被广泛应用于研究植物转录组的动态变化、剪接轨迹及其复杂调控机制。这些研究强调了植物转录组在响应发育过程和环境条件变化中的重要作用,并为理解植物生物学提供了许多重要见解。但由于读长的限制以及在RNA反转录成cDNA进行文库构建扩增过程中可能引入的偏倚,使得分析共转录和后转录加工事件变得更加困难。 直接RNA测序(Direct RNA Sequencing, DRS)技术是基于Nanopore平台的长读长直接RNA测序技术,克服了传统短读长RNA测序所面临的诸多局限性,如读长限制和PCR扩增偏差,DRS能够对原生的全长转录本进行精确检测,可从多方面(新异构体、多聚腺苷酸尾巴(poly(A) tail)以及RNA修饰等)解析植物转录组的复杂性和多样性。 2024年8月18日,广西大学陈玲玲教授团队在Plant Communications期刊 ………………………………

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