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抢发338种脑脊液代谢物孟德尔随机化

生信狂人团队  · 公众号  ·  · 2024-08-10 09:23

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之前的代谢物都是在血液测的,有很多人研究的脑部疾病, 可能更加关心的是在脑脊液中测的代谢物,因此,使用这些脑脊液代谢物来做孟德尔随机化就显得非常重要,显得更加有临床意义。 这些脑脊液代谢物来源于这篇文献,一共有338种脑脊液代谢物: 这些数据都上传到了GWAS catalog网站,可以轻松下载: 不过,下载好的数据是不能直接用的,因为没有提供SNP ID, 没有办法直接用来做孟德尔随机化分析,因此需要自己手动转换SNP ID: 转换ID需要花费大量时间和精力 ,这个不好弄,特别是批量转换338个文件,普通人的电脑根本运行不动,如果是16G内存的笔记本电脑估计直接死机,对电脑配置要求比较高: 转换ID需要一定的编程能力,同时需要强悍的电脑,快的话估计要一个星期,慢的话估计要一个月,相当于至少要浪费7天时间在转换ID上: 需要 ………………………………

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