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对于刚入门蛋白质组学的小伙伴们或许经常能够在文献中看到“ 自上而下（Top-down） ”、“ 自下而上（Down-up） ”和“ 鸟枪法（Shotgun） ” 这三个词，带来不少的困惑，下面就让我们一起来了解这三个词的具体含义和区别。 自上而下（Top-down） 概念 ：直接 分析完整的、未经消化的蛋白质。 步骤 ：将完整的蛋白质通过质谱仪进行分析，质谱可以测量出蛋白质的分子量和结构信息。 优点 ： 保留了 蛋白质的完整结构信息，包括翻译后修饰（如磷酸化、甲基化等） 。 可以获得 蛋白质异构体或亚型 的信息。 缺点 ： 对于大分子蛋白质来说，分离和分析较为困难。 需要高分辨率和高精度的质谱仪。 适用场景：用于需要精确蛋白质结构信息的研究，如翻译后修饰或蛋白质异构体分析。 2. 自下而上（Bottom-up） 概念 ： 通过将蛋白质样本酶解成小肽段，
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