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香港科技大学提出DualNetGO模型,通过高效的特征选择对偶网络预测蛋白质功能

智药邦  · 公众号  ·  · 2024-08-13 09:00
    

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蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络是自动标注蛋白质功能的关键。由于同一组蛋白质存在多个PPI网络,这些网络从不同方面捕获特性,因此有效利用这些异构网络是一项具有挑战性的任务。最近,一些深度学习模型结合了PPI网络,将网络上的图嵌入连接起来用于蛋白质功能预测。然而,由于不同PPI网络的密度、结构和噪声水平各不相同,不加选择地结合蛋白质特征会增加噪声水平,导致模型性能下降。可以说,高效的特征选择程序的缺乏,阻碍了对不同PPI网络信息的有效利用。 2024年7月4日,香港科技大学(广州)罗琼教授团队在Bioinformatics上发表文章DualNetGO: a dual network model for protein function prediction via effective feature selection。 作者提出了DualNetGO,这是一个由分类器和选择器组成的对偶网络模型,通过有效地选择来自不同来源的特征来预测蛋白质功能 , ………………………………

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