#分子模拟# PRODIGY 预测蛋白蛋白亲和力工具

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PRODIGY是一个 Haddock组 做的预测蛋白亲和力值的脚本，其同时也有在线服务，服务网址为:http://milou.science.uu.nl/services/PRODIGY/ 该文章为2015年发表在Elife上，标题为 Contacts-based prediction of binding affinity in protein-protein complexes. 具体的详细算法可查看该篇文章。 在线介绍视频可以在百度网盘查看（英文）:https://pan.baidu.com/s/1dFF0n9f 在线使用 我们可以看到在线界面非常简单，可选择的内容很少 第一列为蛋白蛋白复合物的结构，可以上传 PDB 格式或者 mmCIF 格式，或者直接上传 PDB ID ，若有多个结构的话可以打包成压缩文件(.tar, .tgzi, .zip, .bz2 or .tar.gz)一次性上传。 Interactor 主要是就是输入相互作用的列啦，这个比较好理解，后面就是预测的相互作用温度，默认25度。 可能相较于 ………………………………