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转录组数据分析中,WGCNA(权重基因共表达网络分析)能将大量基因根据表达模式划分到模块中,再以模块为单位进行分析,将基因、样本、模块、性状相互关联起来。 WGCNA分析常适用于大样本的分析中。不仅大大减少了运算量,也提高了分析准确性。 其分析思路可大致分为3步:模块划分、核心模块选择、核心基因分析。 基迪奥Omicsmart转录组在线分析平台 中 WGCNA关联平台 包含 模块划分、样本分析、模块分析、基因调控网络图 等的分析板块,贯穿WGCNA分析思路,助力快速进行数据挖掘! Power值测试 WGCNA根据无尺度网络原则分析基因间的相关性,从而更容易找到起关键调控作用的基因。 在这个计算过程中,β值(power值)会影响基因之间的相关性和连通性,所以选择需要最佳β值是进行WGCNA分析关键的第一步。一般以相关系数尽可能大的同时也要保证
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