专栏名称: 基迪奥生物
广州基迪奥生物官方公众平台,小圆每天分享各种生信软件使用技巧, 搜罗好玩的科研生活,定期还有掉节操的生物界八卦分享,让科研变得有意思咯~
今天看啥  ›  专栏  ›  基迪奥生物

WGCNA怎么做?利器出手,挖掘核心模块与基因!

基迪奥生物  · 公众号  ·  · 2024-10-18 18:03

文章预览

转录组数据分析中,WGCNA(权重基因共表达网络分析)能将大量基因根据表达模式划分到模块中,再以模块为单位进行分析,将基因、样本、模块、性状相互关联起来。 WGCNA分析常适用于大样本的分析中。不仅大大减少了运算量,也提高了分析准确性。 其分析思路可大致分为3步:模块划分、核心模块选择、核心基因分析。 基迪奥Omicsmart转录组在线分析平台 中 WGCNA关联平台 包含 模块划分、样本分析、模块分析、基因调控网络图 等的分析板块,贯穿WGCNA分析思路,助力快速进行数据挖掘! Power值测试 WGCNA根据无尺度网络原则分析基因间的相关性,从而更容易找到起关键调控作用的基因。 在这个计算过程中,β值(power值)会影响基因之间的相关性和连通性,所以选择需要最佳β值是进行WGCNA分析关键的第一步。一般以相关系数尽可能大的同时也要保证 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览