专栏名称: 生信分析手册
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6+CD4+ T细胞+孟德尔随机化,非常值得典藏!!

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-09-10 18:07

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ Roles of naïve CD4+ T cells and their differentiated subtypes in lung adenocarcinoma and underlying potential regulatory pathways ”,这篇文章发表在 J Transl Med 期刊上,影响因子为6.1。 结果: 初始 CD4 T 细胞对 LUAD 有保护作用 使用显着性阈值为 p < 0.05 的 IVW 方法,作者筛选了 336 个 T 细胞表型,鉴定了 T 细胞的 12 个亚型(图 D)。1表 S3 显示了 12 个亚型的计算结果,以及它们的 P 值和 FDR 值。这 12 种 T 细胞亚型来源于两种性状类型:MFI (n = 8) 和 RC (n = 4)。计算结果总结在表中1. 应用假发现率 (FDR) 方法校正原始 p 值,只有初始 CD4 T 细胞上的 CD4 显示出显着差异 (FDR < 0.05)。图 1 中的森林图+1B 显示了 5 种计算方法的结果。IVW 和加权中位数等主要算法表现出与一致 HR 的显著差异,表明 CD4 对 LUAD 上幼稚 CD4 T 细胞的抑制作用。 ………………………………

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