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生存资料的决策曲线分析DCA

医学和生信笔记  · 公众号  ·  · 2024-05-31 08:56
    

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关注公众号,发送 R语言 或 Python ,获取学习资料! 前面介绍了logistic回归的DCA的5种绘制方法,今天学习下cox回归的DCA绘制方法。也是有多种方法可以实现,但我比较推荐能返回数据,用 ggplot2 自己画的那种。 生存资料的DCA 方法1 方法2 方法3 方法4 生存资料的DCA 方法1 使用 dcurves 包,使用的数据集是包自带的 df_surv 数据集,一共有750行,9列,其中 ttcancer 是时间, cancer 是结局事件,TRUE代表有癌症,FALSE代表没有癌症。 并不是只有结局事件是生存或者死亡的才叫生存资料哦!只要是 time-event 类型的,都可以。 # 加载R包和数据,不知道怎么安装的请看我前面的推文 library (dcurves) library (survival) data( "df_surv" ) # 查看数据结构 dim(df_surv) ## [1] 750   9 str(df_surv) ## tibble [750 × 9] (S3: tbl_df/tbl/data.frame) ##  $ patientid       : num [1:750] 1 2 3 4 5 6 7 8 ………………………………

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