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写在开头 之前整理Dotplot结果系列推文: 有 Dotplot可视化细节之如何计算百分比和表达量平均值 ,一起理解了一下Dotplot的结果数据。也基于ggplot2简单的对结果进行了美化—— 使用ggplot2美化Dotplot结果 ,最后借助GPT尝试复现了文章里面的结果图—— 热图联动点图展示Marker基因 近期在整理 scCustomize包美化seurat基础可视化函数的内容,那这期一起学习一下Dotplot的美化叭! scCustomize包中美化Dotplot主要是两个函数: DotPlot_scCustom 以及 Clustered_DotPlot DotPlot_scCustom自定义气泡图 使用自定义的颜色梯度进行绘图 因为Dotplot函数限制了只显示两个颜色,所以就算是指定多个颜色梯度,也不能使用到全部的颜色 DotPlot(object = pbmc, features = g, cols = mycolors) + theme(axis.text.x = element_text(angle = 45, hjust = 1)) DotPlot结果 DotPlot_scCustom(seurat_object = pbmc, features =
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