单细胞转录组的背景知识和分析流程

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学习笔记总结于『生信技能树』马拉松课程 本文学习单细胞转录组的一些简单背景知识和大致分析流程 一、学习基础 在正式开始学习单细胞转录组之前，希望我们已经具备了图1的条件 图1 第1、3点可详见本公众号的系列一；第2点可详见本公众号的系列三 图2 二、什么是单细胞转录组 系列三涉及的转录组是 bulk转录组 ，现在常说的scRNA-seq是 单细胞转录组 以前是直接取一个部位、一块组织，不管这里面是什么细胞都给打碎混在一起从中提取基因去测表达量。但是这些基因曾经在哪些细胞里面，就不得而知了，因为当年的技术没有这么深入。这就是常规转录组，叫做bulk（理解成一大块肉） 而单细胞则是一块一块的小格子， 单细胞是以细胞为单位去测基因表达量 ，而不是以取出来的一大块组织做样本为单位去测 差异分析 是为了将两个有意义的分组 ………………………………