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图形再多也不怕,富集分析我自有妙招

SCIPainter  · 公众号  ·  · 2024-11-01 11:00
    

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在Omicshare的十几个富集分析相关工具中,kegg富集分析、GO富集分析工具毫无意外是最受欢迎的,相关的富集图形中属富集气泡图、富集圈图更受关注。但还是有同学在做富集分析时混淆了显著性气泡图 & 富集气泡图、显著性柱状图 & 富集分析条形图,富集分析的多种结果图怎么分辨、在什么情况下适用哪种图?今天再来一起看看吧。 首先复习下 图例 ,通常在富集气泡图、富集条形图中用到Pvalue、Qvalue或-log10Pvalue、-log10Qvalue指示数据变化,若 P值非常小 ,使用 -log10Pvalue 可以更好地区分显著性水平,例如P值为0.0001时,-log10Pvalue为4,数值越大显著性越高,比直接展示0.0001更方便比较;若数据范围较大且 希望直接展示P值 ,则可以使用 Pvalue ,数值越小显著性越高;Qvalue与-log10Qvalue同理; 左:动态富集条形图工具输出;右:富集气泡图工具输出 接着 ………………………………

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