开源免费+用户友好+跨平台兼容？真有这么好用的MD模拟软件？

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分子动力学（ Molecular Dynamics, MD）模拟是一种计算机模拟技术，基于经典力学定义的简单的势函数描述原子间相互作用，可以模拟从单个分子到数百万原子的复杂体系，如小分子、蛋白质、高分子聚合物等体系及其混合体系。它的应用领域也非常广泛，包括生物分子模拟，来模拟蛋白质、核酸等生物大分子的动态行为，研究其功能和相互作用，还能应用在材料科学、药物设计等诸多领域。 MD模拟软件有很多，各自适用于不同的研究领域，其中， GROMACS是目前最流行的一款高性能MD模拟软件 ，它在模拟生物分子领域中表现出色，同时也适用于非生物体系的模拟。它也包含诸多优点，包括开源免费、模拟速度极快、功能全面、十分灵活等， 凡是GROMACS能计算的体系，都优先推荐使用GROMACS来进行处理 ，因此GROMACS是我们学习MD模拟最应当优先掌握的程序。 ………………………………