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堪比“双胞胎”的PCoA与PCA图,它们有什么区别?

SCIPainter  · 公众号  ·  · 2024-08-21 11:28
    

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上周发现有小伙伴提问PCA与PCoA的分析结果数据是不是通用?毕竟这俩图看起来简直一毛一样: Hold on hold on hold on,虽然PCA图跟PCoA图长得像极了“没有血缘关系的亲兄弟”,但他俩区别还是很大的。先前已经介绍过 PCA图 (点击查看往期文章),今天再来看看如何用omicshare小工具轻松获得PCoA图: 整理数据 PCoA工具支持上传丰度数据及距离矩阵数据两种类型: 丰度表格文件示例 距离矩阵表格 如选择 丰度数据 ,工具默认先计算每个样本OTU相对丰度信息,再计算样本间Bray-Curtis距离,最后才是PCoA计算及绘图;结果文件夹中对应给出Bray-Curtis.matrix数据; 如选择 距离矩阵文件类型 ,则直接进行分析和作图。 并且静态PCoA工具支持上传最多两组分组文件,在结果图中体现为散点颜色、形状分别代表不同分组;分组名称支持自定义更改; 两组分组 *注意,虽 ………………………………

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