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fastenloc "未成功的"使用历程

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2024-10-02 21:30

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fastENLOC(fast enrichment estimation aided colocalization)是一种用于遗传学研究的方法,它通过贝叶斯统计模型来分析和确定基因组中的特定变异(如单核苷酸多态性,或SNPs)是否与某些遗传特征或表型共定位。共定位分析旨在识别那些可能影响特定生物学特征的遗传变异,例如基因表达或复杂疾病的遗传易感性。 fastENLOC方法特别关注于在个体SNP/变异分辨率下揭示共定位信号,使用概率量化来评估某个SNP是否同时影响多个性状或分子QTL(quantitative trait loci)。在实施过程中,fastENLOC通过引入一组参数(α0, α1),称为“富集参数”,来参数化Pr(γ=1|d),其中α1是量化分子QTL在GWAS(genome-wide association studies)命中中的富集水平的对数比率。 此外,fastENLOC方法在处理数据时,会考虑潜在的等位基因异质性(allelic heterogeneity),即同一基因座上的不同遗传变异可能 ………………………………

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