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代码分享|| 泛癌分析思路来了!超大数据量:30种癌症、490万个单细胞转录组、137个空间转录组的文献分享

生信技能树  · 公众号  ·  · 2024-07-03 09:10
    

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生信技能树一直致力于华语地区生信知识的普及,本次针对多年来呕心沥血整理的资源来给大家进行资源分享,包括但不限于介绍带有完整代码和数据的图表复现资源,不同大学免费公开的公开课介绍,免费电子书籍资源介绍等~ 本次分享的文献是 一篇超大数据量的泛癌型的单细胞与空间转录组数据分析!提供了两个超大整理好的数据表单,再也不担心如何找数据了。作者也提供了对这个大数据量分析的python代码,以及图片可视化部分的R脚本 。除此之外,作者的结果还可以在网站进行查询: https://cellatlas.kaist.ac.kr/ecosystem/ 我觉得这篇文章分析最有意思的地方值得大家一看的是: 接近500万个单细胞,作者是如何进行上下游分析的吧?如何减轻计算负担的吧?如何进行多数据集、多组织数据整合与注释的吧? 数据介绍 作者将分析代码和处理后的数 ………………………………

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