Nat Biotechnol | 钱年超等开发体积DNA显微镜：从内到外构建生物体的3D空间转录组

文章预览

淋巴组织、神经组织和肿瘤组织的复杂生理特性源自生物大分子 （ DNA ， RNA ，蛋白质） ，细胞在其所处的空间环境中的三维 （ 3D ） 相互作用，因此，理解生物大分子，细胞在 3D 空间环境中的分布及相互作用对于阐明发育过程、疾病机制和组织功能都至关重要。 传统的单细胞测序方法可以高通量地检测 RNA/DNA 并鉴定细胞类型，但是无法揭示 RNA/DNA 及细胞在样品中的具体位置，也无法解析它们之间的相互作用。传统的光学成像方法 （如免疫荧光染色和原位杂交） 可以提供生物大分子的空间信息，但通常在通量上受到限制，并且需要对检测目标有先验知识。基于测序的空间转录组学技术可以高通量地检测 RNA 的同时，揭示 RNA 及细胞的空间环境，有助于理解在特定空间环境下 RNA 和细胞的行为，但是，该类技术通常需要在样本上强加预定的 XY 坐标 ………………………………