NAR：GutMetaNet——人类肠道菌群HGT网络及功能冗余数据库

文章预览

研究背景 宏基因组研究揭示了复杂的微生物相互作用，包括水平基因转移（HGT）和功能冗余（FR），在塑造肠道微生物组的功能和稳定方面的关键作用。已经开发了多种关于HGT事件和FR的分析方法和数据库，但对于肠道微生物这一领域，目前仍缺乏有针对性、全面的数据集成和系统分析方法。 针对这一现状，香港科技大学李帅成团队建立了GutMetaNet，一个包含 21567个人类肠道宏基因组样本HGT事件及FR分析的 数据库，该成果于2024年8月发表在 Nucleic Acids Research 上。 研究内容 研究团队对有关人类肠道微生物组的已发表文献进行了全面调查，从96个项目中收集到21567个样本的宏基因组数据。数据库样本大部分来自美国（4793）和中国（3800）。来自老年人（45-60岁）的样本最多（3703）。就健康状况而言，样本包括肠易激综合症（2090）、结直肠肿瘤（759）、肥 ………………………………