《Nature》：SCimilarity：跨平台跨组织横向比较单细胞图谱

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昨天，旧金山 Genentech 公司 Aviv Regev 、 Jason A. Vander Heiden 、 Josh Kaminker 、 Graham Heimberg 共同通讯在《 Nature 》发表论文“ A cell atlas foundation model for scalable search of similar human cells ”，开发了 SCimilarity ，一种用于单细胞 RNA 测序（ scRNA-seq ）数据分析的深度度量学习基础模型，能够在不同研究和组织中高效搜索和比较单细胞图谱，为细胞生物学提供了有价值的见解。 【目前论文状态为 Accelerated Article Preview/unedited version ，尚未最终发布（ before final publication ），论文细节可能存在错漏或需要改进的地方。】 同时，通讯作者之一的 Aviv Regev 还通讯在《 Nature 》发表 perspective“ The Human Cell Atlas from a cell census to a unified foundation model ” ，讨论了人类细胞图谱的不同层次功能。 SCimilarity 结合了无监督和监督学习，以优化单细胞图谱的统一表示。通过使用监督三元 ………………………………