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当导师只给我一个RNA-Seq数据,我是怎么设计出5个课题的?

猫头鹰教室  · 公众号  ·  · 2024-07-26 12:30

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本人刚进课题组时,由于经费有限,导师在临床上的工作也非常繁忙,基本处于散养状态,课题组的师兄师姐都是自己想办法毕业的,因此对我来说,需要自己考虑博士开题和毕业的问题。 进课题组后刚开始还是不知所措,问了一圈后发现只有 3 年前做的一个组学的结果还能用:当时师姐做了脑卒中 MCAO 的小鼠模型,后来请公司做了 6 个脑组织样本的转录组测序(时间点是 3h , RNA-Seq ),其中假手术 Sham 组与 MCAO 组(共 2 组)各 3 例( 3 对 3 ),小鼠周龄是 8 周(并非老年鼠),当时公司也提供了测序的分析结果,主要就是差异基因、功能富集、蛋白互作这些。师姐拿到数据后,挑选了一个基因 X 首先做了 qRT-PCR 、 WB 验证,然后做了小胶质细胞的 M1 极化表型,后来又检测了一些炎症因子 TNFα 、 IL-1β 等,发了一篇 3 分的文章就毕业了。 后来这 ………………………………

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