专栏名称: 生信钱同学
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生信新思路,据我目前的观察,至少临床样本中这样做的还不多,还是有创新性的。

生信钱同学  · 公众号  ·  · 2024-08-05 07:00

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🏁🏁🏁觉的有意思的地方:先天性耐药、后天性耐药的比较;代码比较丰富,很值得学习 文章的创新点可以从以下几个方面总结:多模态单细胞与空间多组学整合:文章提出了一种多模态整合工具包(MIT),将单细胞RNA测序(scRNA-seq)、CITE-seq(RNA和蛋白质层面)以及PhenoCycler空间成像数据进行整合。这种方法有效地结合了转录组学、蛋白质表达和空间信息,使研究者能够更深入地理解肿瘤微环境(TME)中的细胞动态和空间结构。这种整合不仅能够解析肿瘤内的异质性,还能揭示不同治疗反应类型(如先天性耐药、后天性耐药和治疗反应)的细胞谱系及其演化。 揭示耐药肿瘤的免疫逃逸机制:通过对接受免疫治疗的转移性黑色素瘤患者的肿瘤进行纵向分析,文章发现了一种“免疫追求”肿瘤微环境的表型。这种表型特征在于肿瘤外围形成的淋巴样聚集 ………………………………

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