蛋白互作网络PPI分析流程示例

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蛋白互作网络（PPI, Protein-Protein Interaction Networks）可以查看基因之间的联系，进而锁定关键基因。一般使用STRING数据库获取蛋白互作信息。 STRING数据库： STRING: functional protein association networks (string-db.org) 数据准备 要分析蛋白的名称列表，例如： 使用STRING数据库获取PPI结果 选择Multiple proteins，将蛋白名称粘贴到List Of Names框中。我这里使用的是果蝇的相关蛋白，因此Organisms选择了Drosophila。点击search。 通过复选框选择对应的蛋白（默认选择的有时候不一定对），点击MAPPING可以下载当前查询到的蛋白信息，点击CONTINUE可以获得蛋白互作结果。 蛋白互作网络图如下 图例信息在Legend中 Settings中可以根据需要改变网络样式。 Exports可以将图片和蛋白互作信息导出。 在网页界面，可以通过鼠标拖动改变蛋白分布。 点击对应的蛋白节点能够查看蛋白结构信息。 ………………………………