梯度型样本的核心分析点——趋势分析，拿捏！

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通过差异分析挖掘对照组和实验组两组间表达差异的基因，是转录组常用的分析方法之一。 但当涉及梯度处理（ 如时间变化、生长周期、浓度变化等 ）的实验设计，常会更关注3组及以上分组的比较，并从中分析基因随着梯度设置变化的规律。 趋势分析 则是我们探索基因表达趋势的重要环节，也是梯度类文章的 核心分析点 。 趋势分析本质上是按表达趋势对基因进行归类。将大量基因通过聚类的方法归类至几个或者几十个趋势中，用于挖掘具有相同表达模式的基因，从而对这些表达趋势相同的基因进行后续分析，如富集分析等。 趋势分析常见结果展示包括总览图、阴影图或单个趋势模块图。 总览图 通过总览图可展示所有趋势模块，及模块内基因的整体表达趋势。通过将大量基因按表达趋势归类，缩小研究范围，大大简化分析难度。其中，带颜 ………………………………