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一种揭示组织空间指纹的新方法

生物通  · 公众号  ·  · 2024-06-06 12:26
    

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在疾病研究中,了解基因表达及其在组织中的位置非常重要,但将两组信息结合起来可能具有挑战性。 美国科罗拉多大学医学院生物医学信息系二级聘任医学助理教授Fan Zhang说:“单细胞技术,尤其是新兴的空间转录组学领域的单细胞技术,可以帮助科学家了解组织中基因的开启或关闭位置。它将基因活动信息与疾病组织中的确切位置结合起来。这真的很有价值,因为它让医生和研究人员不仅可以看到哪些基因是活跃的,还可以看到它们在哪里活跃,这可以为了解不同细胞在疾病状态下的行为和相互作用提供关键的见解。” 直到现在,有效地结合位置和遗传信息一直是研究人员面临的一个难题。 Zhang和她的实验室开发了一种新的计算机器学习方法——称为空间转录组多视图,简称“STew”。这使得空间变异和基因表达变化的联合分析能够以一种可 ………………………………

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