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CADD系列之pymol一键设置多种格式
医药速览
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· · 2024-10-08 08:30
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在我们有多个分子对接的结果需要处理分析的时候,会发现经常进行部分重复性的操作,比如设置图片显示的背景,蛋白的颜色,类型等等。使用 pymol 绘图次数多了之后,不免会想是否有办法能够直接调用我们常用风格的格式,来一键设置蛋白。 现在我们就来介绍 一种设置 pymol 脚本的方法, 可将载入的蛋白文件一键设置成我们需要的格式,省去部分重复劳动,提高绘图效率。 1、 写脚本 使用电脑自带的记事本即可写脚本文件,根据我们需要设置的格式,可以在网上或 pymol wiki 搜到对应的命令,比如设置背景颜色为白色,我们在 pymol 的命令窗口输入 bg_color white 即可实现,因此在脚本中也可使用该命令,例如设置 label 字体格式为 Gentium Roman ,对应的命令是 set label_font_id, 15 ,依此类推,常用的格式均有对应指令可查询。如下图所示,则是一个简 ………………………………
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