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Nat Biotechnol丨突破染色质研究瓶颈:Droplet Hi-C助力异质组织和肿瘤的基因调控分析
生物探索
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公众号
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生物
· 2024-10-19 15:30
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引言 细胞核内DNA完全展开的长度约2米,而一般细胞核的直径仅有10-20微米,因此基因组在空间上是高度折叠的。基因组的折叠不是无序的,其蕴含着重要的调控信息。基于染色质构象捕获测序技术 (Hi-C技术) ,人们将染色质高级结构分为染色质环、拓扑关联域、A/B 区室和染色质领地四个层级。染色质高级结构在生物发育和疾病的发生发展过程中起着重要作用。在发育过程中,染色质结构通过远端调控元件影响基因表达的开启或关闭。异常的染色质结构会导致基因表达异常,进而促进癌症的发生发展。 传统的Hi-C技术是对细胞群体进行建库测序,无法解析特定细胞类型相关的特异性染色质结构。因此对于细胞类型组成复杂的组织样品,需要单细胞Hi-C技术且需要在单个组织样品中同时测定成百上千个单细胞才能覆盖复杂的细胞类型。目前已有的单 ………………………………
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