专栏名称: 生信媛
生信媛,从1人分享,到8人同行。坚持分享生信入门方法与课程,持续记录生信相关的分析pipeline, python和R在生物信息学中的利用。内容涵盖服务器使用、基因组转录组分析以及群体遗传。
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检索疫情数据的R包来了!

生信媛  · 公众号  · 生物  · 2020-02-11 10:26
    

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安装 在R里跑下面这句,包就安装好了。 remotes::install_github( "GuangchuangYu/nCov2019" ) 使用起来相当容易,小白也会用,看完就知道了,再菜的鸟也必须会用。 初印象 library (nCov2019) x < - get_nCov2019() 加载包之后,用一条语句,拿到当前最新的数据,每天都可以跑一下,拿到最新的数据。 打印一下你拿到的数据,它会显示中国确诊的人数,以及这个数据的更新时间: > x China (total confirmed cases): 14489 last update: 2020 - 02 - 02 19 : 22 : 51 更新时间很重要,因为数字是不断在更新,比如你使用当前的数据来画图,你想在图上加个时间注释,为了让这事变得更容易, nCov2019 包提供了 time 方法,返回数据更新时间: > time(x) [ 1 ] "2020-02-02 19:22:51" 数据源来自于腾讯,如果你想在线访问,使用 open(x) ,它会打开浏览器,直接到达页面: 各省数据 只需要用 x[] ,就能拿 ………………………………

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