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研究前沿:浙江大学-深度学习大规模药物发现 | Nature Computational Science

今日新材料  · 公众号  ·  · 2024-08-22 00:03

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大规模药物研发和再利用,是极具挑战的。确定作用机制mechanism of action (MOA) 是至关重要的,但目前的方法,成本高,产量低。 今日,浙江大学药学院、之江实验室联合美国斯坦福大学等,在Nature Computational Science上发文,提出了通过分析线粒体表型变化,确定药物作用机制MOA的方法。 通过对线粒体形态和膜电位进行时间成像,建立了用于监测时间分辨线粒体图像的流程,产生了包含570,096个单细胞图像的数据集,这些单细胞图像是暴露于1,068种美国食品和药物管理局批准药物的细胞。还开发了名为MitoReID深度学习模型,利用了重新识别re-identification (ReID)系统框架和膨胀3D ResNet主体网络。 在测试集上,获得了76.32% Rank-1和65.92%平均精度,并在线粒体表型的基础上,成功鉴定了6种未经训练的药物作用机制MOA。MitoReID将环氧化酶-2抑制确定为茶叶中天然化 ………………………………

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