专栏名称: 生信分析手册
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生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-07-23 18:00

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‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“ A High Immune-Related Index with the Suppression of cGAS-STING Pathway is a Key Determinant to Herceptin Resistance in HER2+ Breast Cancer”,这篇文章发表在 Int J Biol Sci 期刊上,影响因子为8.2。 结果: I 型 IFN 信号转导的下调与 HER2+ BC 患者的不良预后相关 为探讨HER2靶向治疗如何改变HER2+ BC的特征,从03-311试验中获取HER2+ BC患者的RNA表达和相应的临床数据GSE76360队列。在基线和短暂暴露于单药赫赛汀后对肿瘤活检进行RNA表达谱分析,这可以排除其他治疗干扰(图1A). 首先,为了发现与 HER2+ BC 预后最相关的基因模块,使用一剂赫赛汀治疗后 HER2+ BC 患者的表达谱进行 WGCNAGSE76360队列(图1A)。软阈值功率值设置为6,用于后续分析(图S1A)。进行动态模块鉴定,将5个共表达模块聚类,蓝色模块与临床反应呈最强正相关(Cor = 0.45,p < 1e-200)( ………………………………

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