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多细胞生物发育过程依赖于基因的时空特异性表达,这一过程受到谱系特异性转录因子与增强子等功能性顺式转录调控元件(cis-regulatory elements, CRE)的调控。2020年,DNA元件百科全书(ENCODE)计划通过系统绘制小鼠胎儿发育的多组织多发育阶段的转录与表观遗传图谱,注释了数十万个发育相关的CRE元件。 然而,大部分CRE调控的靶基因尚不明确。染色质远程互作是基因组复杂转录调控机制中的重要一环,增强子通过染色质远程互作与目标调控基因自空间中形成物理互作。利用高通量测序技术检测发生在增强子与启动子间的染色质远程互作是识别增强子靶基因的有效手段。然而,目前尚缺乏对小鼠胎儿发育阶段的染色质远程互作的系统性研究。 2024年12月16日, 复旦大学生命科学学院于淼团队 于 Nature Structural & Molecular Biology 杂志在线发表了题为 “Int
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