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NC|单细胞ATAC-seq揭示小鼠次级腭发育

吉凯基因  · 公众号  ·  · 2024-12-18 17:25
    

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点击 蓝字 关注我们 单细胞开放染色质测序是一种前沿技术,用于分析单个细胞中的开放染色质区域,从而揭示基因调控的动态特征。其基本原理是利用转座酶在细胞中切割并标记开放的DNA区域,然后通过高通量测序技术获取这些区域的序列信息。通过比对这些序列,可以识别特定基因的调控元件和结合蛋白,从而深入了解基因表达调控机制。2024年,来自美国德克萨斯大学的研究人员,利用该技术对小鼠次级腭发育进行了研究,接下来小编就带大家看一下,文章具体从哪些角度对数据进行了挖掘。 单细胞多组学剖析腭的发育过程 为了在细胞水平上剖析发育小鼠的次级腭的基因调控机制,作者在E12.5(n=2)、E13.5(n=3)、E14.0(n=2)和E14.5(n=2)时从相同的细胞生成scRNA-seq和scATAC-seq文库(图1a),得到36154个细胞,32285个基因和123807个代表潜在调 ………………………………

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